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自律神經系統則比較快速而短暫，但彼此都共有一個特點，
就是非意識所能控制，各自有一套運作法則來維持人體的內在環境穩定，
這也就是自律神經系統為何叫做「自律」的理由。
自律神經系統分為交感神經與副交感神經，分佈在內臟、血管、腺體等器官的神經上，
它們共同控制呼吸、心跳、胃腸、生殖、分泌、排汗、體溫等功能。
例如心跳的控制，並不是說你的意識想讓它快，它就快，
要它慢就慢，可是一旦你跑步，你的交感神經就會使心跳自然加快，
一旦你休息或睡覺時，你的副交感神經就會使心跳自然變慢，一點都不用你擔心。

為什麼會自律神經失調？
一旦內在或外在環境的壓力或變化過大過久，或者個體所容許的內在穩定環境範圍過小，
自然就很容易超過自律神經能調控的範圍而造成失調，例如升學壓力、失業、失戀、
離婚、親友傷亡、車禍或意外傷害、生病和睡眠不足、或二尖瓣脫垂的患者，
都容易有一段時期。
甚或經常出現自律神經失調的症狀：
常見的有心悸、胸悶、呼吸困難、眼前發黑、頭暈、頭痛、頸肩僵硬緊繃、昏倒、
手腳無力、麻木感、腰痠背痛、失眠盜汗、腹瀉或便秘、排尿困難或尿失禁、
性功能異常、情緒不穩定、體溫過低或過高等現象，這些失調現象如未能適當調整，
有可能造成惡性循環，終至內在環境失序、內分泌失調及其他器官系統的病變。
自律神經失調，過去受限於儀器未能精密到足以偵測出功能性的變化，
加上自律神經的調控相當快速而且短暫，在技術上相對比較困難，所幸由於電腦科技的進步，
專家們已經可以把許多的生理訊號拿來做更深入的分析，
從而可以由這些生理訊號的細微變化推測出自律神經如何來調控這些生理現象。
其中，心率變異度分析算是發展的比較完整的一種檢查，只要收集一小段時間的心電圖訊號，
我們就可以推估調控心臟的交感神經或副交感神經是否失調及其程度變化，
更重要的是治療以後的反應，也可以用心率變異度分析來追蹤及評估。

自律神經功能失調之症狀
我們知道自律神經負責以上所介紹的各項功能，
一旦它的功能失調，將會有各種系統異常之症狀。

例如：心臟血管系統異常引起常見的姿勢性低血壓，
它是當患者姿勢改變時，會覺得眼前發黑、頭暈、
甚至昏倒；嚴重的情況，患者會有缺血性腦中風的現象，
更有因而造成失智症的病例。
消化系統異常，患者出現經常性腹瀉或便秘，
帶來日常生活的困擾。

泌尿生殖系統不正常則容易發生排尿困難或尿失禁；
當然也會有性功能異常，而深深影響著患者的情緒，
但情緒因素也是性功能異常之病因，二者間互為因果。

呼吸系統常是因情緒、心理因素等，
發生過度換氣的症狀即呼吸淺而快之現象，
造成呼吸困難甚至昏倒。

自律神經包含交感神經及副交感神經，
共同控制呼吸、心跳、胃腸、泌尿生殖、排汗、體溫....等功能
所以一但自律神經失調...可能會有這些器官上面的異常徵象

「自律神經系統」則擔任調節體內環境的工作，
幾乎所有的器官都受到「自律神經系統」控制，
從心臟的跳動快慢功能、血管的收縮快慢功能、
瞳孔的擴張功能、腸胃蠕動快慢的功能、、等等，
這都是屬「自律神經系統」所掌控的。